Dans les Pyrénées-Orientales, l'assainissement collectif est assuré par 186 stations d'épuration (31/12/2009), qui permettent de traiter les eaux usées de 972 000 habitants. Les stations sont construites pour traiter le volume des effluents en période de pointe (été et hiver).

Le nombre total d'installations a augmenté de près de 9% depuis 1990. Cette augmentation concerne principalement les petits ouvrages (< 200 EH - augmentation de 80 %), ce qui témoigne de l'effort de ces collectivités pour s'équiper d'un système de traitement. Il existe 22 petites rurales ne sont pas équipées de stations d'épuration, mais les rejets ont impact minime sur les milieux naturels.

Lits de roseaux station de Caramany

Le département est principalement équipé de petites stations d'épuration (< 2 000 EH). Les grosses unités (> 10 000 EH) sont peu nombreuses (20), mais la charge polluante pouvant être traitée par ces installations est considérable.

Le parc de stations d'épuration se renouvelle petit à petit. Le nombre de station d'épuration ayant moins de 30 ans correspond à 62% du parc.

Sur les 10 dernières années, 51 stations d'épuration ont été construites soit près de 30 % du parc actuel, 62% des stations du département ont moins de 30 ans.

Ces investissements importants ont été possible grâce au soutien financier du Conseil général et de l'Agence de l'Eau. En 2009, plus de 1 200 000 € de travaux ont été subventionnés.

La quantité de boues évacuées en 2009 a été, (hors Perpignan), de l'ordre de 4 500 tonnes de matières sèches hors Perpignan (soit environ 22 600 tonnes de boues brutes sans compter les boues traitées sur lits à macrophytes).

La gestion en régie est prépondérante avec 67 % (y compris prestation de service), contre 33 % pour la gestion déléguée. Par contre, la gestion déléguée concerne surtout les unités assez importantes, la taille moyenne des stations étant de 7 600 EH alors qu'elle n'est que de 2 800 EH pour la gestion en régie. L'évolution depuis 2000, montre une augmentation du nombre de station exploitées en régie (y compris prestation de service). Cette évolution est en partie due à l'équipement de petites collectivités en système de traitement mais aussi à un retour en régie sur certaines collectivités (Communauté de communes des Albères, SIVM du Sègre, SIVM de la vallée du Carol).